Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms