Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sema3cQ62181 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms