Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msi1Q61474 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms