Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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