Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Samhd1Q60710 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samhd1Q60710 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms