Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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CttnQ60598 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CttnQ60598 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CttnQ60598 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms