Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Phf12Q5SPL2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf12Q5SPL2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms