Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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