Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Znf354cQ571J5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms