Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Lrrc47Q505F5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms