Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms