Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC051142Q3V0M8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms