Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms