Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc27Q3V036 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms