Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms