Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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