Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms