Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nhlrc4Q3UP44 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms