Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmem253Q3UNB8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem253Q3UNB8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms