Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
BtrcQ3ULA2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
BtrcQ3ULA2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms