Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms