Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Kdm4dQ3U2K5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms