Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pnpla6Q3TRM4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pnpla6Q3TRM4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms