Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rtl9Q32KG4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl9Q32KG4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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