Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbp8Q2V6D6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gbp8Q2V6D6 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gbp8Q2V6D6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms