Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chrna5Q2MKA5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms