Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms