Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms