Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnnm1Q0GA42 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms