Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
AmbpQ07456 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
AmbpQ07456 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms