Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cdx4Q07424 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms