Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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