Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prrx2Q06348 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms