Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Igsf9Q05BQ1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Igsf9Q05BQ1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Igsf9Q05BQ1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms