Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1Q04750 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms