Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Thbs2Q03350 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms