Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1sQ02789 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms