Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mc1rQ01727 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Mc1rQ01727 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms