Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjb2Q00977 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb2Q00977 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb2Q00977 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms