Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SeleQ00690 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms