Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms