Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nbr1P97432 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nbr1P97432 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nbr1P97432 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nbr1P97432 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms