Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Arf1P84078 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Arf1P84078 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Arf1P84078 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Arf1P84078 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms