Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tp53bp1P70399 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tp53bp1P70399 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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