Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smad1P70340 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smad1P70340 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smad1P70340 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smad1P70340 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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