Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdlim4P70271 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms