Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxd13P70217 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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