Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gnb1P62874 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms