Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gabra1P62812 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra1P62812 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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