Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dpf3P58269 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dpf3P58269 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms